Με την ίδρυση της Α’ Εθνικής Κατηγορίας τον Ιούνιο του 1959, ο τότε πρόεδρος της ΑΕΚ Νίκος Γκούμας, μετά από εισήγηση του προπονητή της ομάδας Τρύφωνα Τζανετή, δίνει το εξωπραγματικό για την εποχή ποσό των 103.000 δραχμών και πέντε ποδοσφαιριστές για να εντάξει στο δυναμικό της ΑΕΚ τον Μαρδίτση επικρατώντας έτσι του ΠΑΟ που διεκδικούσε επίσης τον παίκτη.
Έκανε ντεμπούτο με την φανέλα της ΑΕΚ στις 23 Σεπτεμβρίου 1959 σε αγώνα Κυπέλλου με την Προοδευτική όπου η ΑΕΚ είχε πάρει τη νίκη με σκορ 4-0. Πανύψηλος για τα δεδομένα της εποχής με ύψος 1.84 μ., χρησιμοποιείται από τον Τρύφωνα Τζανετή στις 13 Δεκεμβρίου 1959 στην Τούμπα απέναντι στον ΠΑΟΚ σε θέση κεντρικού αμυντικού αντικαθιστώντας τον τραυματία Νίκο Μελισσή. Έκτοτε καθιερώνεται στην θέση αυτή ξεχνώντας το ποδοσφαιρικό του παρελθόν στον χώρο των επιθετικών και δημιουργώντας με παρτενέρ τον Μίλτο Παπαποστόλου ένα απροσπέλαστο δίδυμο στο Ενωσίτικο κέντρο άμυνας.
Αγωνίστηκε με την Κιτρινόμαυρη φανέλλα από το 1959 μέχρι το 1963 κερδίζοντας το πρωτάθλημα της περιόδου 1962-63. Είχε 115 συμμετοχές ενώ σημείωσε και ένα γκολ. Η τελευταία εμφάνιση του με την φανέλλα της ΑΕΚ ήταν στις στις 7 Ιουλίου 1963 στην ήττα με 1-0 από τον Άρη στο Καυταντζόγλειο. Μετά την ΑΕΚ συνέχισε την καριέρα του για ακόμη ένα χρόνο στην Κόρινθο και τον Ιούνιο του 1964 αποχώρησε από την ενεργό δράση. Υπήρξε 28 φορές διεθνής με την Εθνική Ενόπλων.
